Агропромышленный комплекс является основным сектором экономики района, и его состояние оказывает значительное воздействие на социально-экономическую ситуацию.
По состоянию на 1 января 2018 года на территории района функционирует 79 предприятий, занимающихся производством и реализацией сельскохозяйственной продукции, в том числе: 4 сельскохозяйственных производственных кооператива (им.Кирова, им. Калинина, «Нива-1», «Колос»), 63 ИП КФХ, 6 ООО («Лидер», «Агротех», «Победа», «Васелга», «Башкирский молочно-растительный птицекомплекс», «Муслюмовский птицекомплекс»), один сельскохозяйственный потребительский кооператив - СПоК «Овощи+», 5 прочих предприятий, производящих продукцию АПК: Белокатайский филиал Дуванского многопрофильного колледжа, подсобные пришкольные участки и другие, а также 7719 личных подсобных хозяйств населения.
Валовая продукция сельского хозяйства в 2017 году в действующих ценах составила 2 млрд. 247 млн. рублей, или 104,6 % к уровню прошлого года, в том числе в общественном секторе 333,5 млн. рублей, или 14,8 %, в КФХ – 232 млн. рублей, или 10,3 % от общей суммы. Объём отгруженных товаров собственного производства, работ и услуг, выполненных собственными силами, по виду деятельности «Производство пищевых продуктов, включая напитки» по предприятиям АПК за 2017 год составил 25 млн. 545 тыс. рублей, произведено продукции (работ, услуг) по предприятиям, обслуживающим сельское хозяйство, на 1 млн. 862 тыс. рублей.
Общая площадь сельскохозяйственных угодий составляет 116,9 тыс. га, в том числе пашни – 50,2 тыс. га, сенокосов 38 тыс. га, пастбищ – 28,7 тыс. га.
В целом по району в 2017 году посевная площадь зерновых и зернобобовых культур составила 18 776 га, картофеля 826 га, овощей открытого грунта 132,9 га. Под урожай 2018 года озимых культур посеяно на площади 3,2 тыс. га, вспахано зяби – 4,5 тыс. га, засыпано семян 3 тыс. тонн, или 100 % от потребности.
Валовый сбор зерновых культур в 2017 год составил 25 344 т. в весе после доработки.
Урожайность зерновых и зернобобовых культур в среднем по району составила 13,5 ц/га в весе после доработки, (наибольшая в ИП глава КФХ Сусев А.П. – 18,4ц/га, в ООО "Агротех" и ИП глава КФХ Дрёмин Д.В. - 17,8 ц/га, ИП глава КФХ Миндибаев И.М. – 16,8 ц/га, СПК имени Кирова - 15,7 ц/га). Урожайность озимой пшеницы в ООО «Агротех» составила 19,4 ц/га, наибольшая урожайность озимой ржи получена в ООО СП «Победа» – 18,2 ц/га.
Серьезное внимание уделяется в районе вопросам стабилизации и дальнейшему развитию одной из важнейших отраслей сельского хозяйства – животноводству. По состоянию на 1 января 2018 года во всех категориях хозяйств имеется 11 724 головы крупного рогатого скота (100,9 % к уровню 2016 года), в том числе 6 578 коров (100,7%), 221 голова свиней (89,5%), 19 668 голов овец и коз (101,2%), 2 401 голова лошадей (103,4%), 40 545тыс. голов птицы (95,2%) и 8584 пчелосемей (103,8 %).
За 2017 год хозяйствами района всех форм собственности произведено 291 949 ц молока (101,1%), 66 175 ц скота и птицы в живом весе (100,7%), в том числе КРС 44 768 ц (101,7%). Надой на одну фуражную корову составил 4 734 кг (102,5%). За год реализовано продукции животноводства по всем каналам сбыта: скота и птицы в живом весе 55 802 ц (101,6%), в том числе КРС 41 378 ц (100,7%), молока 259039 ц (100,8%). В общественном секторе поголовье скота по состоянию на 1 января 2017 года составило: крупного рогатого скота – 3 076 голов (101% к 2016 году), в том числе коров 1 327 голов (100 %), лошадей 272 головы (101,5%), 314 голов овец и коз (100,0%).
Сельскохозяйственными производственными кооперативами района в 2017 году произведено (выращено) скота и птицы в живом весе 3 016 ц (71,4%), в том числе крупного рогатого скота 2 890 ц (102,8%), произведено 43 232 ц молока, или (101,5%) к аналогичному периоду прошлого года). Надой молока на одну фуражную корову составил 3 445 кг, или 101,5% к прошлому году. Среднесуточный привес КРС за 2017 год составил 513 гр, или 100,2% к прошлому году.
Недавно принята муниципальная программа «Развитие агропромышленного комплекса муниципального района Белокатайский район Республики Башкортостан до 2020 года». Ежегодно для развития сельскохозяйственных предприятий выделяется финансовая помощь. Так, за 2017 год получено субсидий из бюджетов обоих уровней на сумму 8,8 млн. рублей (в 2016 г. 20,2 млн. рублей), что составляет 43,5 %, в том числе на оказание поддержки в области растениеводства – 5 млн. 93 тыс. рублей, повышение продуктивности КРС молочного направления – 1 824,5 тыс. рублей, на возмещение части процентов ставки по кредитам ЛПХ - 620,1 тыс. рублей.
За 2017 год сельскохозяйственными предприятиями приобретено 11 единиц новой техники на сумму 4,24 млн. рублей (2 зерноуборочных комбайна (б/у), 1 трактор (б/у), легковой автомобиль, 2 плуга, 2 пресс-подборщика, 3 единицы граблей).
Основными задачами развития АПК на сегодняшний день являются сохранение и повышение плодородия почв, внедрение научно обоснованных систем земледелия, освоение ресурсо - и энергосберегающих технологий, увеличение урожайности возделываемых сельскохозяйственных культур на основе новых районированных сортов, а также сохранение поголовья крупного рогатого скота и прежде всего коров, увеличение производства продукции животноводства и продуктивности сельскохозяйственных животных.